Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnpo2Q99LG2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms