Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf144aQ925F3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf144aQ925F3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms