Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgs1Q923W1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms