Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mtmr3Q8K296 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mtmr3Q8K296 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms