Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Abcf3Q8K268 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Abcf3Q8K268 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Abcf3Q8K268 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Abcf3Q8K268 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Abcf3Q8K268 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Abcf3Q8K268 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Abcf3Q8K268 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Abcf3Q8K268 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Abcf3Q8K268 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Abcf3Q8K268 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Abcf3Q8K268 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Abcf3Q8K268 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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