Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Polr1eQ8K202 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Polr1eQ8K202 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
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