Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Nek9Q8K1R7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Nek9Q8K1R7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Nek9Q8K1R7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Nek9Q8K1R7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nek9Q8K1R7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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