Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sec22cQ8BXT9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms