Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rbbp5Q8BX09 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rbbp5Q8BX09 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms