Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Ctdsp2Q8BX07 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdsp2Q8BX07 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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