Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms