Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cldn34b3Q80ZS5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms