Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
NischQ80TM9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
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NischQ80TM9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NischQ80TM9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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