Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctdp1Q7TSG2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms