Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Actn1Q7TPR4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms