Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubfd1Q78JW9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubfd1Q78JW9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ubfd1Q78JW9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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