Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cnih3Q6ZWS4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms