Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt9Q6RHW0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms