Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PrimpolQ6P1E7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrimpolQ6P1E7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms