Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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