Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ss18Q62280 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ss18Q62280 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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