Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sycp1Q62209 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms