Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sin3bQ62141 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sin3bQ62141 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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