Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nell2Q61220 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms