Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Klf3Q60980 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms