Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
JrkQ60976 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
JrkQ60976 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms