Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prdm1Q60636 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms