Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWP3

Nacad, NAC-alpha domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacadQ5SWP3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NacadQ5SWP3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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