Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS91

Sun3, SUN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sun3Q5SS91 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sun3Q5SS91 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sun3Q5SS91 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sun3Q5SS91 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sun3Q5SS91 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sun3Q5SS91 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sun3Q5SS91 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sun3Q5SS91 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sun3Q5SS91 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sun3Q5SS91 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms