Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Trappc1Q5NCF2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms