Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc3lQ4KL14 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms