Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm28047Q3US59 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm28047Q3US59 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms