Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Znf48Q3US17 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Znf48Q3US17 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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