Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc34Q3UI66 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms