Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Palb2Q3U0P1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Palb2Q3U0P1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms