Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gtf3c3Q3TMP1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf3c3Q3TMP1 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms