Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Shroom4Q1W617 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Shroom4Q1W617 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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Shroom4Q1W617 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
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