Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lmntd2Q0VET5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lmntd2Q0VET5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms