Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
MitfQ08874 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms