Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms