Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cacna1sQ02789 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms