Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Hoxd1Q01822 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms