Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Mc1rQ01727 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Mc1rQ01727 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms