Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Itga4Q00651 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Itga4Q00651 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms