Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Snrpd1P62315 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms