Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Usp25P57080 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp25P57080 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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