Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp5P56399 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms