Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Defa6P50704 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Defa6P50704 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms