Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Abcd1P48410 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Abcd1P48410 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms