Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
VhlP40338 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
VhlP40338 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
VhlP40338 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms